58
εξειδικευμένοι εκκινητές έναντι του ιού
Hippeastrum mosaic virus
(HiMV, γένος
Potyvirus
) από την
περιοχή του γονιδίου της καψιδιακής πρωτεΐνης του ιού, μετά από στοίχιση όλων των σχετικών
νουκλεοτιδικών αλληλουχιών που υπήρχαν στη διεθνή βάση δεδομένων (GeneBank). Ως καθοδικός
χρησιμοποιήθηκε ο εκκινητής 5’-CCGAGCATCGAGTGCATGTT-3’ και ως ανοδικός ο 5’-
GCCACGATATGCAATTCAGAG-3’ σε αντίδραση αντίστροφης μεταγραφής- αλυσιδωτής αντίδρασης
της πολυμεράσης (RT-PCR) για την ανίχνευση του HiMV σε συμπτωματικά φύλλα φυτών
Hippeastrum
. Το αναμενόμενο προϊόν PCR μεγέθους 245 bp ελήφθη σε όλες τις περιπτώσεις. Η
αλληλουχία νουκλεοτιδίων του προϊόντος αυτού είχε 95% ταυτότητα με την αντίστοιχη περιοχή της
απομόνωσης του HiMV Euch-B από τη Βραζιλία (GenBank acc. no JF690747) και 94% ταυτότητα με
τις απομονώσεις TW από Taiwan (GenBank acc. no AY590143), Αλάσκα από ΗΠΑ (GenBank acc. no
GQ857550) και Rilona από Ολλανδία (GenBank acc. no EF203685). Η αναφορά του ιού του
μωσαϊκού του είδους
Hippeastrum
(
Hippeastrum mosaic virus
) στην Ελλάδα έγινε για πρώτη φορά στη
χώρα μας.
2.2.10 Μελέτη της προσαρμογής του ιού Υ της πατάτας (
Potato virus Y
, PVY) στο
φυτό-ξενιστή πιπεριά
Οι απομονώσεις του ιού Υ της πατάτας
(
Potato virus Y
, PVY, γένος
Potyvirus
), ταξινομούνται σε
τέσσερις κύριες φυλογενετικές ομάδες O, N, C1 και C2. Από αυτές μόνο οι απομονώσεις της ομάδας
C1 μολύνουν διασυστηματικά το φυτό-ξενιστή πιπεριά. Βιολογικός χαρακτηρισμός σειράς
ανασυνδυασμένων μολυσματικών ιϊκών κλώνων μεταξύ των απομονώσεων PVY-C1, PVY-N και PVY-
C2, κατέδειξε την κωδική περιοχή P3 σαν εκείνη που καθορίζει τη μολυσματικότητα του ιού στην
πιπεριά. Επιπλέον, πειράματα εξέλιξης έδειξαν ότι η ανάκτηση της μολυσματικότητας σε φυτά
πιπεριάς ορισμένων ανασυνδυασμένων ιών σχετίζεται με μονές αντικαταστάσεις αμινοξέων στη
περιοχή P3. Κατευθυνόμενη μεταλαξογένεση επιβεβαίωσε το ρόλο τουλάχιστον ενός αμινοξέος στην
ικανότητα μόλυνσης του ιού στο συγκεκριμένο ξενιστή. Μετατόπιση του πλαισίου ανάγνωσης εντός
της περιοχής που κωδικοποιεί την πρωτεΐνη P3, οδηγεί επιπλέον στην παραγωγή της πρωτεΐνης P3N-
PIPO. Η κωδική περιοχή P3 και η εμπεριεχόμενη P3N-PIPO κλωνοποιήθηκαν ξεχωριστά και
εκφράστηκαν μέσω του φορέα του ιού του κροταλίσματος του καπνού (
Tobacco rattle virus
, TRV) σε
φυτά πιπεριάς. Η δυνατότητά τους να επιφέρουν στην απομόνωση PVY-N την ικανότητα να μολύνει
το φυτό-ξενιστή πιπεριά μέσω δράσης
in trans
διερευνάται.
Τ
ΜΗΜΑ
Φυτοπαθολογίας
Ε
ΡΓΑΣΤΗΡΙΟ
Ιολογίας
Υ
ΠΕΥΘΥΝΟΣ
Ε
ΡΓΟΥ ΓΙΑ ΤΟ
ΜΦΙ
Δρ Ν. Βασιλάκος
Ε
ΜΠΛΕΚΟΜΕΝΟ
Π
ΡΟΣΩΠΙΚΟ
Χ. Παναγιωτίδη, Ε. Στάμου* (*στα πλαίσια της
διπλωματικής εργασίας του προγράμματος
προπτυχιακών σπουδών του Τμήματος Βιολογίας
του Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών)
Δ
ΙΑΡΚΕΙΑ
Ε
ΡΓΟΥ
2.1.2013 - 31.12.2014
Κ
ΑΛΥΨΗ
Δ
ΑΠΑΝΗΣ
100% ΜΦΙ
Τ
ΜΗΜΑ
Φυτοπαθολογίας
Ε
ΡΓΑΣΤΗΡΙΟ
Ιολογίας
Υ
ΠΕΥΘΥΝΟΣ
Ε
ΡΓΟΥ
Δρ Χ. Βαρβέρη
Ε
ΜΠΛΕΚΟΜΕΝΟ
Π
ΡΟΣΩΠΙΚΟ
Δρ Ν. Βασιλάκος, Ι Μαλανδράκη, Χ. Παναγιωτίδη
Δ
ΙΑΡΚΕΙΑ
Ε
ΡΓΟΥ
2.1.2011 - 31.12.2014
Κ
ΑΛΥΨΗ
Δ
ΑΠΑΝΗΣ
100% ΜΦΙ
