55
Ε
ΜΠΛΕΚΟΜΕΝΟ
Π
ΡΟΣΩΠΙΚΟ
Ε. Καλογεροπούλου, Σ. Μιγκάρδου, Η. Γεωργίου
Δ
ΙΑΡΚΕΙΑ
Ε
ΡΓΟΥ
2 έτη (1.1.2013-31.12.2014)
Κ
ΑΛΥΨΗ
Δ
ΑΠΑΝΗΣ
100% ΜΦΙ
2.2.5 Διμερής Ε & Τ Συνεργασία Ελλάδας-Κίνας 2012-2014 της Δράσης Εθνικής
Εμβέλειας «Διμερείς, Πολυμερείς και Περιφερειακές Ε & Τ Συνεργασίες», έργο:
Small RNA-mediated antiviral agri-biotechnology (sRNAvac)
Για την υλοποίηση των στόχων του προγράμματος που αφορά στη διέγερση του μηχανισμού άμυνας
των φυτών έναντι φυτοπαθογόνων οργανισμών με χρήση μικρών μορίων RNA που προκαλούν ‘σίγηση’
της έκφρασης γονιδίων του παθογόνου, επιλέχθηκαν ως πειραματικά μοντέλα τα παθοσυστήματα: α)
CMV-τομάτα, β) ZYMV-καρπουζιά και γ) TYLCV-τομάτα. Η στρατηγική παραγωγής αυτών των RNA
μορίων βασίζεται στη χρησιμοποίηση βακτηριακών κυττάρων και την επαγωγή έκφρασης σε αυτά των εν
λόγω μορίων. Για τον ιό CMV χρησιμοποιήθηκαν τα βακτηριακά στελέχη με τις γονιδιακές κατασκευές που
είχαν παραχθεί σε παλαιότερο ερευνητικό πρόγραμμα (Πυθαγόρας ΙΙ, COST Action FA0806) για την
παραγωγή των RNA μορίων. Για τα δύο άλλα ιικά παθογόνα, διενεργήθηκε συστηματική ανασκόπηση της
βιβλιογραφίας προκειμένου να συλλεχθούν ερευνητικά δεδομένα για τυχόν σίγηση γονιδίων των εν λόγω
παθογόνων που σχετίζεται φαινοτυπικά με μείωση της παθογένειάς τους. Βάσει των δεδομένων αυτών,
επιλέχθηκαν δύο γονίδια για κάθε ιό. Για κάθε γονίδιο επιλέχθηκαν συντηρημένες περιοχές για το
σχεδιασμό εκκινητών για PCR, προκειμένου να απομονωθούν τα υπό μελέτη γονίδια. Προς την
κατεύθυνση αυτή έχει ξεκινήσει η δημιουργία των γονιδιακών κατασκευών για την παραγωγή των RNA
μορίων που στοχεύουν στη σίγηση των επιλεγμένων γονιδίων για τους ιούς TYLCV και ΖΥΜV.
Παράλληλα, πραγματοποιήθηκε παραγωγή σε βακτηριακά κύτταρα (
in vivo
παραγωγή) μορίων RNA κατά
του ιού CMV. Τα «βακτηριακά» αυτά μόρια RNA θα εφαρμοστούν σε τεχνητές μολύνσεις φυτών για την
αξιολόγηση της δραστικότητάς τους.
Σ
ΥΝΤΟΝΙΣΤΗΣ
Ε
ΡΓΟΥ
GeORION Ltd
Ε
ΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΟΣ
Υ
ΠΕΥΘΥΝΟΣ
Ε
ΡΓΟΥ
Επικ. Καθ. Α. Βολουδάκης (Γεωπονικό Πανεπιστήμιο
Αθηνών
Ε
ΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΗ
Υ
ΠΕΥΘΥΝΗ ΓΙΑ ΤΟ
ΜΦΙ
Δρ Μ.Κ. Χολέβα
Ε
ΜΠΛΕΚΟΜΕΝΟ
Π
ΡΟΣΩΠΙΚΟ
ΜΦΙ
Δρ Μ.Κ. Χολέβα, Χ. Ρέππα (Συνεργάτης με σύμβαση
εργασίας ιδιωτικού δικαίου ορισμένου χρόνο στο
Πρόγραμμα)
Σ
ΥΜΜΕΤΕΧΟΝΤΕΣ
Φ
ΟΡΕΙΣ
GeORION Ltd, Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών
2.2.6 Συμμετοχή σε διεθνή Διεργαστηριακή Δοκιμή (Ring Test) μεθόδων για τη
μελέτη ανίχνευσης και ταυτοποίησης του φυτοπαθογόνου βακτηρίου
καραντίνας
Erwinia
amylovora, στο πλαίσιο του προγράμματος Phytfire που
χρηματοδοτείται μέσω του ευρωπαϊκού προγράμματος EUPHRESCO
Σκοπός της Διεργαστηριακής Δοκιμής ήταν η διαμόρφωση διαγνωστικής μεθοδολογίας για την
ανίχνευση και ταυτοποίηση σε δείγματα ασυμπτωματικών φυτών-ξενιστών του φυτοπαθογόνου
βακτηρίου
Erwinia
amylovora,
που προκαλεί τη γνωστή ασθένεια ‘Βακτηριακό κάψιμο των μηλοειδών’,
με τη συνεργασία των Εργαστηρίων από διάφορα ευρωπαϊκά ερευνητικά κέντρα. Μία τέτοια
μεθοδολογία είναι απολύτως αναγκαία για την πρόγνωση επιδημιών οφειλόμενων στο
Ε. amylovora.
Το ‘Βακτηριακό κάψιμο’ αποτελεί μια από τις σοβαρότερες ασθένειες των μηλοειδών στη χώρα μας,
και η έλλειψη αποτελεσματικής διαγνωστικής μεθόδου για ασυμπτωματικά φυτά, λόγω της παρουσίας
χαμηλού συνήθως πληθυσμού του βακτηρίου και της ανομοιογενούς κατανομής του στο φυτό,
